Библиотека Казанской православной духовной семинарии обладает богатым фондом книг, который является наследием Казанской духовной академии. 

В силу трагических событий в 20 веке большая часть фонда была рассредоточена по многим государственным библиотекам и библиотекам советских вузов. Сейчас книжный фонд семинарии постепенно возвращает литературу, которая ранее была утрачена. 

В недавнем времени в книжный фонд семинарии из библиотеки Свято-Троицкой Сергиевой Лавры вернулись три книги со штампами Казанской духовной академии: 

1. Левиратный брак у древних евреев 
2. Наставление к разведению аврекулей, анютиных глазок, ранункулей, анемонов и душистой фиалки 
3. Памяти Андрея Кононовича Волкова. 

Эти издания являются уникальными и не имеют копий в библиотеке семинарии. В библиотеку Свято-Троицкой Сергиевой Лавры они были переданы Из Российской государственной библиотеки.