В 1864–1867 гг. архимандрит Вениамин (Быковский) занимал должность инспектора Казанской духовной академии, являлся ординарным профессором и членом академической конференции, а также членом Казанского духовно-цензурного комитета.
Выпускник Киевской духовной академии. До назначения в Казань был ректором 2-го Орловского духовного училища, затем инспектором Херсонской духовной семинарии и помощником ректора по профессорской должности, преподавал французский язык и учение о расколе.
По окончании службы в Казани был ректором и профессором богословских наук Воронежской духовной семинарии.
В 1871 году хиротонисан во епископа Острогожского, викария Воронежской епархии. С 1879 года – епископ Оренбургский и Уральский, с 1882 года – епископ Черниговский и Нежинский.
Скончался 1 (13) февраля 1893 года в Чернигове. Погребен в главном Троицком храме Троице-Ильинского монастыря под алтарем, рядом с могилой архиепископа Филарета (Гумилевского).
Его перу принадлежат несколько сочинений богословского, аскетического и философского содержания. Многочисленные слова, беседы и речи на различные церковные праздники отражают его проповеднический талант.